Las funciones del Ministerio del Interior se encuentran establecidas, principalmente, en el nuevo artículo 3 de la Ley 20.502. Estas son:

• Coordinación gubernamental: Coordinar políticamente los ministerios según las directrices presidenciales.
• Gestión intersectorial: Coordinar y hacer seguimiento programático de la gestión gubernamental, apoyar comités interministeriales e informar sobre innovaciones en la administración pública.
• Análisis y estudios: Realizar estudios y análisis de corto y mediano plazo para decisiones políticas.
• Supervisión de auditorías: Supervisar la coordinación de auditorías internas en servicios públicos.
• Descentralización y equidad territorial: Implementar medidas para descentralización administrativa y fiscal, coordinando con gobiernos regionales y locales.
• Desarrollo regional y local: Promover el desarrollo territorial, con especial atención a zonas extremas y rezagadas.
• Gobierno interior: Colaborar con la Presidencia en la conducción del gobierno interior del Estado.
• Ejecución de leyes electorales: Garantizar la correcta aplicación de la legislación electoral.
• Política migratoria: Formular, implementar y supervisar políticas migratorias y de protección de refugiados.
• División política y administrativa: Proponer normas sobre división territorial y husos horarios.
• Control del Diario Oficial: Supervisar su funcionamiento y reglamentación.
• Relaciones con el Congreso: Conducir las relaciones con el Congreso Nacional en materias que no correspondan a otros ministerios.
• Gestión de emergencias: Coordinar la prevención, respuesta y reconstrucción ante desastres y emergencias.
• Convenios y acuerdos: Firmar acuerdos con instituciones públicas y privadas para la ejecución de políticas y programas.
• Conflictos sociales: Coordinar la prevención y respuesta ante conflictos sociales en conjunto con los ministerios correspondientes.
• Administración digital: Gestionar la Red de Conectividad del Estado.
• Regulación de vehículos estatales: Aplicar disposiciones sobre uso y circulación de vehículos del Estado.
• Bienes municipales: Coordinar la disposición de bienes municipales con el Ministerio de Bienes Nacionales.
• Pensiones de gracia: Prestar soporte administrativo para su otorgamiento.
• Relación con Bomberos: Coordinar acciones con la Junta Nacional de Cuerpos de Bomberos y cuerpos locales.
• Otras funciones: Desempeñar atribuciones adicionales establecidas por la ley.